Protein–RNA interactions for Protein: P01803

Ig heavy chain V region AMPC1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01803 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01803 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01803 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01803 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P01803 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01803 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01803 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01803 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
P01803 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01803 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01803 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01803 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01803 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01803 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01803 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01803 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01803 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01803 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms