Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P01800 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P01800 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01800 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
P01800 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P01800 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
P01800 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
P01800 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
P01800 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
P01800 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P01800 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
P01800 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms