Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01790 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01790 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01790 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01790 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01790 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P01790 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01790 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01790 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01790 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms