Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01748 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01748 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01748 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01748 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01748 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01748 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01748 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01748 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01748 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01748 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01748 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01748 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01748 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms