Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01735 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01735 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01735 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01735 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01735 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01735 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01735 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01735 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01735 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01735 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01735 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01735 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01735 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01735 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01735 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01735 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01735 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01735 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01735 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms