Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ifna1P01572 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ifna1P01572 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms