Protein–RNA interactions for Protein: O89079

Cope, Coatomer subunit epsilon, mousemouse

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopeO89079 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CopeO89079 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CopeO89079 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CopeO89079 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CopeO89079 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CopeO89079 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CopeO89079 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CopeO89079 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CopeO89079 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CopeO89079 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CopeO89079 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms