Protein–RNA interactions for Protein: O89001

Cpd, Carboxypeptidase D, mousemouse

Predictions only

Length 1,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CpdO89001 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpdO89001 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpdO89001 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpdO89001 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpdO89001 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CpdO89001 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CpdO89001 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CpdO89001 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CpdO89001 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CpdO89001 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CpdO89001 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CpdO89001 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CpdO89001 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CpdO89001 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CpdO89001 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms