Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcn2O88968 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcn2O88968 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcn2O88968 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms