Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apaf1O88879 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Apaf1O88879 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Apaf1O88879 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms