Protein–RNA interactions for Protein: O88783

F5, Coagulation factor V, mousemouse

Predictions only

Length 2,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5O88783 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F5O88783 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
F5O88783 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
F5O88783 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
F5O88783 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
F5O88783 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
F5O88783 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
F5O88783 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
F5O88783 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
F5O88783 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
F5O88783 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
F5O88783 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
F5O88783 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
F5O88783 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms