Protein–RNA interactions for Protein: O88632

Sema3f, Semaphorin-3F, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3fO88632 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sema3fO88632 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sema3fO88632 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms