Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CntfrO88507 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CntfrO88507 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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