Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nme6O88425 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nme6O88425 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nme6O88425 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms