Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sorl1O88307 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sorl1O88307 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms