Protein–RNA interactions for Protein: O88200

Clec11a, C-type lectin domain family 11 member A, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec11aO88200 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Clec11aO88200 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Clec11aO88200 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Clec11aO88200 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms