Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox6O70238 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rhox6O70238 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rhox6O70238 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rhox6O70238 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms