Protein–RNA interactions for Protein: O70167

Pik3c2g, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3c2gO70167 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pik3c2gO70167 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pik3c2gO70167 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pik3c2gO70167 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms