Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Psmb5O55234 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Psmb5O55234 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms