Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
OtogO55225 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
OtogO55225 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OtogO55225 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OtogO55225 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OtogO55225 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OtogO55225 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OtogO55225 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms