Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nipsnap2O55126 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap2O55126 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap2O55126 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms