Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nck2O55033 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Nck2O55033 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms