Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Copb2O55029 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copb2O55029 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Copb2O55029 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Copb2O55029 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms