Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sema6bO54951 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sema6bO54951 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sema6bO54951 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms