Protein–RNA interactions for Protein: O54732

Mmp15, Matrix metalloproteinase-15, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp15O54732 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mmp15O54732 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mmp15O54732 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms