Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccr6O54689 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccr6O54689 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms