Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FxnO35943 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FxnO35943 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FxnO35943 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FxnO35943 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FxnO35943 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FxnO35943 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FxnO35943 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FxnO35943 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms