Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccl25O35903 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccl25O35903 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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