Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Timm44O35857 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Timm44O35857 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Timm44O35857 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Timm44O35857 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms