Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Klf12O35738 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Klf12O35738 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms