Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppfibp2O35711 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppfibp2O35711 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppfibp2O35711 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms