Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Notch2O35516 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Notch2O35516 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms