Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Clk2O35491 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clk2O35491 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clk2O35491 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms