Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccrl2O35457 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccrl2O35457 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms