Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TnxbO35452 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TnxbO35452 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
TnxbO35452 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TnxbO35452 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TnxbO35452 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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TnxbO35452 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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