Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Foxd2O35392 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Foxd2O35392 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms