Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cnih1O35372 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cnih1O35372 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cnih1O35372 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cnih1O35372 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cnih1O35372 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms