Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
KeraO35367 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KeraO35367 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
KeraO35367 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KeraO35367 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
KeraO35367 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
KeraO35367 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
KeraO35367 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
KeraO35367 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
KeraO35367 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
KeraO35367 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
KeraO35367 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
KeraO35367 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms