Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sh2d1bO35324 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sh2d1bO35324 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sh2d1bO35324 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms