Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tnfrsf11aO35305 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Tnfrsf11aO35305 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf11aO35305 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf11aO35305 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf11aO35305 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tnfrsf11aO35305 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms