Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PrkcshO08795 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrkcshO08795 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PrkcshO08795 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms