Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcof1O08784 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tcof1O08784 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms