Protein–RNA interactions for Protein: O08736

Casp12, Caspase-12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp12O08736 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Casp12O08736 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp12O08736 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms