Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rundc3aO08576 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rundc3aO08576 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms