Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mesp2O08574 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mesp2O08574 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mesp2O08574 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms