Protein–RNA interactions for Protein: J9JI28

Vwa3b, von Willebrand factor A domain-containing 3B, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa3bJ9JI28 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vwa3bJ9JI28 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vwa3bJ9JI28 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vwa3bJ9JI28 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms