Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Ccer2J3QPU5 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ccer2J3QPU5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ccer2J3QPU5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms