Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm5294J3QP53 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5294J3QP53 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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