Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim34bJ3QNR8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim34bJ3QNR8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms