Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm3336J3QMQ6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3336J3QMQ6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3336J3QMQ6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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